Okulumuz 1967–1968 yılında Niksar-Başçiftlik Ortaokulu olarak açılmıştır. İlk eğitim ve Öğretim hizmetlerini vermeye Belediyeye ait ahşap bir binada başlamıştır. 1991 yılına kadar aynı binada hizmet vermiştir.Ortaokuldan mezun olan öğrenci sayısının artışı, kasaba halkının okumaya karşı gösterdikleri aşırı ilgiden dolayı 1980–1981 yılında lise kısmı açılmış ve yeni ismi Niksar-Başçiftlik Lisesi olarak değiştirilmiştir.
1991–1992 Öğretim Yılında İlköğretim Okulu olarak yaptırılmış bulunun yeni binaya taşınmış ve bünyesinde bulunan Ortaokul Kısmı Başçiftlik İlkokulu ile birleştirilerek Başçiftlik İlköğretim Okulu adını almıştır. 1991–1992 öğretim yılından itibaren Ders Geçme ve Kredi Sistemi uygulanmaya başlamıştır.
Başçiftlik 1991 yılında İlçe olduktan sonra aynı yıl okulumuzun ismi Başçiftlik Lisesi olarak değiştirilmiştir. Daha sonra ilçemiz nüfusuna kayıtlı ve aynı zamanda okulumuz mezunlarından olan Murat KILINÇ’ın Olağanüstü Hal Bölgesinde Şehit olması sebebiyle, şehidimizin ismi okulumuza verilerek Ekim 1994 tarihinden itibaren okulumuzun adı Başçiftlik Şehit Murat Kılınç Lisesi olmuştur. Aynı binada İlçe Milli Eğitim Müdürlüğü ve Halk Eğitim Merkez Müdürlüğü 1991 yılından 2004 Kasım ayına kadar birlikte hizmet vermiştir. İlçe Milli Eğitim Müdürlüğünün Kasım 2004'de Hükümet Binasına taşınması ile birlikte Halk Eğitim Merkez Müdürlüğü ile birlikte hizmet vermeye devam etmektedir. Binası 564 m2 alan üzerine oturtulmuş olup, 4324 m2 bahçe olarak kullanılmakta olan arsası mevcuttur.
OKUL PERSONELİ
ÖĞRETMENLERİMİZ
Ayhan KAYMAK
(Okul Müdürü ve Tarih Öğretmeni)
Mustafa AKYÜZ
(Müdür Yrd.ve Kimya Öğretmeni)
Halil KATMERLİKAYA
(Coğrafya Öğretmeni)
Hilmi ÜNLÜ
(Biyoloji Öğretmeni)
Duran YAYLA
(Tarih Öğretmeni)
Kazım ÖZEL
(T.Dili ve Edebiyatı Öğretmeni)
Fatih S.ZEYBEK
( T.Dili ve Edebiyatı Öğretmeni)
Kahraman COŞKUN
(Fizik Öğretmeni)
Evren ÜSEN
(İngilizce Öğretmeni)
YARDIMCI HİZMETLER PERSONELİ
Atila YÜCE (Hizmetli)
OKUL BİRİNCİLERİMİZ
Şevket KAYA (1982–1983)
Menderes KAYA (1983–1984)
Ayhan KARAYAMA (1984–1985)
Yaşar KAYMAK ( 1985–1986)
Şamil ŞEN (1986–1987)
Cemal AYDIN (1987–1988)
Durmuş KILINÇ (1988–1989)
Erkut AYMAK (1989–1990)
Neşe AYDIN (1990–1991)
Mehmet KOÇ (1991–1992)
İbrahim Erkan AYMAK (1992–1993)
Ümit ŞEN (1993–1994)
İsmail KOÇ (1994–1995)
Ahmet BEYAZIT(1995–1996)
Murat BAYRAM (1996–1997)
Akif AÇIKEL (1997–1998)
Fadime NAMLI (1998–1999)
Nezaket AYAN (1999–2000)
Makbule AYMAK (2000–2001)
Esra OĞUZ (2001–2002)
Ferhat KILINÇ (2002–2003)
Tarık KAYMAK (2003–2004)
BAŞARILARIMIZ
TÜRKİYE GENELİNDE
2003–2004 MASA TENİSİ GENÇ ERKEKLER TÜRKİYE 13.LÜĞÜ
İL GENELİNDE SPOR :
2003–2004 MASA TENİSİ GENÇ ERKEKLER İL 1.LİĞİ
2002–2003 MASA TENİSİ GENÇ ERKEKLER İL 3.LÜĞÜ
2001–2002 MASA TENİSİ GENÇ KIZLAR İL 3.LİĞİ
2000–2001 GENÇ ERKEKLER KROS İL 3.LÜĞÜ
1997–1998 MASA TENİSİ GENÇ ERKEKLER İL 3.LÜĞÜ
1994–1995 MASA TENİSİ GENÇ ERKEKLER İL 1.LÜĞÜ
1992–1993 MASA TENİSİ GENÇ ERKEKLER İL 1.LİĞİ
ÖSS
2003 ÖSS EŞİT AĞIRLIK PUANI GENEL LİSELER TOKAT 1.LİĞİ